与两相双极步进电机的驱动电路相比，两相单极步进电机的驱动电路在输入段配置、内部逻辑及控制电路和驱动电路使用双通道方面基本相同，但是输出段的配置不同。两相双极步进电机使用双通道H桥来驱动，而两相单极步进电机则使用双通道的2个开关（MOSFET）来驱动。

在下面的电路图示例中，Q12和Q14、Q22和Q24是成对的。这是因为，只要使电流从提供给各线圈中心抽头的电源沿一定方向流动，就可以驱动两相单极步进电机。电流从中心抽头流向开关（MOSFET）处于导通状态的OUT引脚。

两相单极步进电机的驱动：
两相励磁PWM驱动波形

下面是两相单极步进电机的两相励磁PWM驱动波形示例。请看输入信号与输出电压/电流之间的关系。

应该注意的是，当驱动两相单极步进电机时，输出OFF时会产生瞬态电压；由于其结构上的原因，变压器耦合会产生反电动势。以OUT11和OUT12的电压波形为例，在OUT11关断的瞬间，会产生输出电压波动超过2×VM（供给中心抽头的电机电压电源）的瞬态电压，由于OUT12再生电流的变压器耦合而回落至2xVM。当OUT11关断时，由于OUT11的电流再生，OUT12波动到GND以下；当OUT11导通时，通过变压器耦合，OUT11的电流变为2×VM，并反复上述过程。因此，需要对电机驱动器的耐压进行考量。