1.准备好需要自动运行的程序，比如123.exe

2.将“123.exe”拷贝到该路径下：WINCE600OSDesignsS3C6410_DEMOS3C6410_DEMORelDirSamsung_SMDK6410_Release.

3.在pc上新建一个“123.txt”的文档，里面填入以下内容：10#Windows123.exe.之后将该文件重命名为 123.lnk

4.修改project.bib文件

FILES
;  Name            Path                                           Memory  
123.exe $(_FLATRELEASEDIR)123.exe NK H
  123.lnk $(_FLATRELEASEDIR)123.lnk NK H
;Type
;  --------------  ---------------------------------------------  -----------

5.修改project.dat文件

Directory('WindowsStartup'):-File('123.lnk','Windows123.exe')

6.修改shell.reg文件（还是在这个路径中：WINCE600OSDesignsS3C6410_DEMOS3C6410_DEMORelDirSamsung_SMDK6410_Release）

[HKEY_LOCAL_MACHINEinit]
'Launch80'='123.exe'
'Depend50'=hex:14,00, 1e,00

7.最后一步Make Run-Time Image.将系统烧到开发板中

以上为整个过程，其中.bib文件全称为Binary Image Builder，其作用为指示构建系统如何构建二进制映像，指示哪些文件被打包到运行时映像中，同时只是如何王目标板上加载模块和文件。.dat文件用来指定当系统冷启动时，FileSys.exe应当如何初始化RAM文件系统结构，可通过DAT文件在Windows CE文件系统的根目录上挂接其他文件夹。